Итак, вот я и переехал в Берлин. Теперь работаю в Max Planck Institute For Infection Biology в качестве PhD студента. Выполнена очердная цель в рамках разработанного плана :) Как обычно, засучив рукава, движемся дальше. Предварительное название моей кандидатской диссертации звучит довольно сурово: "Bioinformatics for Next Generation Sequencing Data and Infectious Pathogens".
Первая неделя моего пребывания в Берлине была насыщена событиями и делами. Для начала нужно было поучаствовать в симпозиуме NGFN, посвященному применению Next Generation Sequencing-технологий для решения реальных клинических задач. Было несколько интересных докладов, но общее впечатление двоякое. С одной стороный NGS-анализ (в частности Genome Wide) уже сейчас позволяет выявлять мутации генов, критические для ряда серьезных заболеваний. С другой стороны большинство опасных болезней, таких как рак или диабет, являются комплексными, и для их точной диагностики требуется учитывать мутации сразу во многих генах, а также огромное количество внешних условий, использовать дополнительные валидации для обеспечения точности считывания. И пока тут еще много нерешенных задач.
Кроме того, пришлось ходить по разным местным конторам: регистрироваться по месту пребывания , открывать аккаунт в банке, и т.д. Коллеги в институте меня пугали немецкой бюрократией, но в итоге все проходило довольно гладко. Подумаешь, просидел час в ожидании регистрации с электронным билетом номера в очереди. Видимо они не были знакомы с русской бюрократией. Первый раз в жизни я ушел из банка удовлетворенный, хаха.
Про работу пока рано что-то говорить, может быть напишу подробный пост через пару месяцев ;)
Берлин просто потрясающий город, и я все больше убеждаюсь в этом. Мой немецкий позволяет мне общаться на самом простом уровне: магазин, кафетерий, улица... Все остальное решается с помощью английского, кажется в Берлине его знает каждый третий, ну или четверый. Так что с языком проблем никаких нет. Начинаю понемногу разбираться в местных хитростях и жизненных мелочах. С Berlin Nightlife я тоже уже успел познакомиться. Вместе с Carboinized (внезапно!) сходили на концерт Modeselector, и это было просто офигительно.
Вообщем есть мнение, что мне в Берлине понравится. Продолжение следует.
суббота, 1 октября 2011 г.
суббота, 17 сентября 2011 г.
teuflisch gut
Случалось ли вам быть знакомым с человеком, который не терпит лжи? Таким человеком, который не приемлет даже малейшей доли неискренности или несправедливости и будет, вопреки всем сложившимся в обществе правилам и стереотипам, отстаивать свою правоту? С человеком, который не приемлет иных авторитетов, кроме разума и совести? С человеком, который не смотря на все то дерьмо, которое порой случается в жизни, продолжает с почти детской наивностью верить людям? А с человеком, который своей внешностью и образом жизни бросает вызов всему миру, но делает это без доли ненависти или злобы к кому либо? С человеком, который больше переживает за весь мир чем за себя? И еще: встречался ли вам когда-нибудь человек с гуманитарным (!) образованием, который бы использовл Linux в качестве домашней системы?
Мне вот посчастливилось быть с таким человеком. Даже прожить вместе одни из самых счастливых дней в моей жизни. Ну и пережить не самые счастливые.
Да, она просто дьявольски хороша, это бесспорно. Но наряду с внешней красотой в ней есть кое-что еще - красота души. И пока встречаются такие люди, в этом мире еще не все потеряно.
Мне вот посчастливилось быть с таким человеком. Даже прожить вместе одни из самых счастливых дней в моей жизни. Ну и пережить не самые счастливые.
Да, она просто дьявольски хороша, это бесспорно. Но наряду с внешней красотой в ней есть кое-что еще - красота души. И пока встречаются такие люди, в этом мире еще не все потеряно.
четверг, 11 августа 2011 г.
Full of Life
я бежал по стадиону, наматывая круг за кругом. темнело.
зловещее красное сияние облаков на западе, черное небо и сверкающие молнии на востоке.
раскаты грома все чаще и чаще.
музыка в ушах заставляет бежать быстрее, кажется это raining blood.
начинается дождь. ливень. хаос.
я продолжаю бежать.
зловещее красное сияние облаков на западе, черное небо и сверкающие молнии на востоке.
раскаты грома все чаще и чаще.
музыка в ушах заставляет бежать быстрее, кажется это raining blood.
начинается дождь. ливень. хаос.
я продолжаю бежать.
пятница, 22 июля 2011 г.
отчет о Вене
Совсем недавно я посетил Вену. Цель моего визита была довольно простой - поучаствовать в конференции BOSC-2011, выступить с устным докладом и получить заслуженный приз за лучший студенческий abstract. Мое выступление конечно же было посвящено проекту UGENE в котором я работаю вот уже 3 года. О UGENE можно долго рассказывать, проект в своем роде уникальный, совмещает в себе много клевых плюшек: биоинформатика, open-source, с++/qt, high performance computing и много чего еще. Но речь сейчас пойдет о другом...
Собственно для меня это был первый раз, когда я присутствовал на конференции такого уровня. Дело в том, что BOSC-2011 проходила в рамках события мирового масштаба в области вычислительной биологии: ISMB/ECCB 2011. По сути это является ключевым событием в данной сфере, в котором участвуют ведущие представители науки, а это такие лабы как US Berkley, MIT, Penn, Maryland, Manchester, EMBL... и много кто еще. Конечно, до этого мне приходилось участвовать в "конференциях", хаха, в Новосибирске, Москве и СпБ. Но как-то сложно теперь говорить об этих междусобойчиках как о серьезных научных событиях.
Вообщем в Вену я прибыл вечером 14 июля. Сразу после выхода из метро у меня был легкий шок. Мировой памятник архитектуры и культуры предстал во всей красе: по центру Вены (так называемому Кольцу) можно просто ходить задрав голову, смотреть по сторонам и офигевать.
Кажется в Вене представлены все архитектурные стили, все обрзачики мировой культуры и здесь жили все великие композиторы. Местные жители, кстати, очень радовали своим видом.
Я поселился в отеле рядом с центром, и это было здорово: до всех достопримечательностей было рукой подать. А на следующий день после приезда я отправлися на конференцию.
Мой доклад был самым первым после key-note, и поэтому я приехал очень рано, боясь не успеть зарегистрироваться. Меня встретил пустой зал F1 в Vienna City Center.
Однако уже очень скоро он заполнился людьми. Слушателей было 100-200 человек. В течение всей BOSC количество несколько варьировалось ведь параллельно проходили другие секции. T.к. я выступал первым, то немного волновался. Впрочем, выступление прошло норм, вопросы были заданы интересные, и надеюсь я ответил на них соотвествующе :) У меня правда был небольшой выброс адреналина, ха-ха, но я быстро оправился, и уже скоро слушал другие доклады и даже задавал вопросы. Потом еще была постерная сессия и ужин в неформальной обстановке, считай вечеринка для участников. На следующий день было еще больше докладов, и еще больше общения. Конференция прошла очень плодотворно в плане налаживания контактов и знакомства с разными интересными людьми.
Самым важным я считаю то, что мое выступление и наш проект были встречены очень хорошо. Здорово было слушать положительные отзывы о нашей работе от людей, известных мне по научным статьям, которые я с интересом читал ранее, и даже по нескольку раз. Было просто офигенно пообщаться с создателями проектов, которые оказали такое влияние на развитие биоинформатики и понять, что то, чем мы занимаемся в UGENE находится в соотвествии с мировыми стандартами.
Еще хочу заметить вот что: на конференциях ISMB-2011 не было ни одного устного доклада из России кроме нашего. Нет, на самом деле русских людей я встретил довольно много. Бывшие соотечественники успешно работают и живут теперь в Штатах, Англии, Германии и других местах. Как известно, Россия сейчас имеет очень низкий авторитет в науке. Однако ученые из России все также пользуются спросом. Правда, хочу заметить, что встретил на ISMB группу Николая Вяххи из СПбАУ. Они представляли постер, и участвовали на конференции в качестве слушателей. Ребята занимаются очень правильным делом, и надеюсь в следующем году уже выступят с докладом. К сожалению, они скорее исключение.
BOSC продолжалсь 2 дня, а ISMB целую неделю. Я участвовал, только в BOSC и поэтому 2 дня после конференции я потратил на прогулки по Вене, благо там есть что посмотреть :) Побывал в доме Моцарта, музее истории пыток, и других клевых местах, но об этом как нить в другой раз.
Собственно для меня это был первый раз, когда я присутствовал на конференции такого уровня. Дело в том, что BOSC-2011 проходила в рамках события мирового масштаба в области вычислительной биологии: ISMB/ECCB 2011. По сути это является ключевым событием в данной сфере, в котором участвуют ведущие представители науки, а это такие лабы как US Berkley, MIT, Penn, Maryland, Manchester, EMBL... и много кто еще. Конечно, до этого мне приходилось участвовать в "конференциях", хаха, в Новосибирске, Москве и СпБ. Но как-то сложно теперь говорить об этих междусобойчиках как о серьезных научных событиях.
Вообщем в Вену я прибыл вечером 14 июля. Сразу после выхода из метро у меня был легкий шок. Мировой памятник архитектуры и культуры предстал во всей красе: по центру Вены (так называемому Кольцу) можно просто ходить задрав голову, смотреть по сторонам и офигевать.
Кажется в Вене представлены все архитектурные стили, все обрзачики мировой культуры и здесь жили все великие композиторы. Местные жители, кстати, очень радовали своим видом.
Я поселился в отеле рядом с центром, и это было здорово: до всех достопримечательностей было рукой подать. А на следующий день после приезда я отправлися на конференцию.
Мой доклад был самым первым после key-note, и поэтому я приехал очень рано, боясь не успеть зарегистрироваться. Меня встретил пустой зал F1 в Vienna City Center.
Однако уже очень скоро он заполнился людьми. Слушателей было 100-200 человек. В течение всей BOSC количество несколько варьировалось ведь параллельно проходили другие секции. T.к. я выступал первым, то немного волновался. Впрочем, выступление прошло норм, вопросы были заданы интересные, и надеюсь я ответил на них соотвествующе :) У меня правда был небольшой выброс адреналина, ха-ха, но я быстро оправился, и уже скоро слушал другие доклады и даже задавал вопросы. Потом еще была постерная сессия и ужин в неформальной обстановке, считай вечеринка для участников. На следующий день было еще больше докладов, и еще больше общения. Конференция прошла очень плодотворно в плане налаживания контактов и знакомства с разными интересными людьми.
Самым важным я считаю то, что мое выступление и наш проект были встречены очень хорошо. Здорово было слушать положительные отзывы о нашей работе от людей, известных мне по научным статьям, которые я с интересом читал ранее, и даже по нескольку раз. Было просто офигенно пообщаться с создателями проектов, которые оказали такое влияние на развитие биоинформатики и понять, что то, чем мы занимаемся в UGENE находится в соотвествии с мировыми стандартами.
Еще хочу заметить вот что: на конференциях ISMB-2011 не было ни одного устного доклада из России кроме нашего. Нет, на самом деле русских людей я встретил довольно много. Бывшие соотечественники успешно работают и живут теперь в Штатах, Англии, Германии и других местах. Как известно, Россия сейчас имеет очень низкий авторитет в науке. Однако ученые из России все также пользуются спросом. Правда, хочу заметить, что встретил на ISMB группу Николая Вяххи из СПбАУ. Они представляли постер, и участвовали на конференции в качестве слушателей. Ребята занимаются очень правильным делом, и надеюсь в следующем году уже выступят с докладом. К сожалению, они скорее исключение.
BOSC продолжалсь 2 дня, а ISMB целую неделю. Я участвовал, только в BOSC и поэтому 2 дня после конференции я потратил на прогулки по Вене, благо там есть что посмотреть :) Побывал в доме Моцарта, музее истории пыток, и других клевых местах, но об этом как нить в другой раз.
понедельник, 20 июня 2011 г.
nostalgiaplatz
Иногда имеет смысл притормозить и окинуть взглядом прошлое. Было ли там что-то стоящее настолько, чтобы вспомнить об этом? Людская память очень выборочна, и извлекаемые воспоминания обычно отрывочны. Можно прожить тысячи минут, сотни часов, десятки лет и не запомнить ничего. А можно помнить какой-нибудь один час из жизни с точностью до секунды.
Принято считать, что чем больше у человека воспоминаний, тем богаче, ярче и интереснее жизнь у него, и это вроде как здорово. Но как быть с тем, фактом что самые дерьмовые моменты в жизни запоминаются порой гораздо лучше, чем самые приятные? "Плохих" воспоминаний может быть мало, но они почти не стираются. Такие воспоминания имеют обыкновение проигрываться в голове снова и снова, закрепляя и пополняя с каждым разом дорожки нейронных связей. А воспоминания о счастливых днях исчезают, теряются, со временем в них не остается деталей - лишь смутные, зыбкие картины и образы. Конечно, это все легко объясняется: "плохие" воспоминания должны сохраниться, чтобы избежать подобных ситуаций в будущем. Все в рамках эволюции видов и отдельно взятого организма. Но каким образом мозг решает, что это воспоминание должно быть сохранено? Может быть триггером является выброс адреналина, или какая-нибудь другая химическая реакция. А скорее целый комплекс реакций в организме.
Очень странно помнить о ничего не значащих вещах. Например, мое первое, как мне кажется, осмысленное воспоминание: мне года 3(?), мы с дедом гуляем по заснеженному парку, он катает меня на санках. Или другой образ из детства: автомат с газировкой. Я жду своей очереди, чтобы бросить монетку, у меня в руках металлическая кружка. И еще миллион подобных образов: из школы и универа, из повседневной жизни, путешествий и поездок, странных или обыденных дней.
Наверняка умные люди уже давно занимаются исследованием вопросов памяти и воспоминаний, и мои наивные догадки вряд ли претендуют на откровения. Скорее это попытка отдельного индивида осмыслить свою жизнь, перебрать старые файлы и папки, осмыслить свежедобавленные, подготовить место для новых.
Принято считать, что чем больше у человека воспоминаний, тем богаче, ярче и интереснее жизнь у него, и это вроде как здорово. Но как быть с тем, фактом что самые дерьмовые моменты в жизни запоминаются порой гораздо лучше, чем самые приятные? "Плохих" воспоминаний может быть мало, но они почти не стираются. Такие воспоминания имеют обыкновение проигрываться в голове снова и снова, закрепляя и пополняя с каждым разом дорожки нейронных связей. А воспоминания о счастливых днях исчезают, теряются, со временем в них не остается деталей - лишь смутные, зыбкие картины и образы. Конечно, это все легко объясняется: "плохие" воспоминания должны сохраниться, чтобы избежать подобных ситуаций в будущем. Все в рамках эволюции видов и отдельно взятого организма. Но каким образом мозг решает, что это воспоминание должно быть сохранено? Может быть триггером является выброс адреналина, или какая-нибудь другая химическая реакция. А скорее целый комплекс реакций в организме.
Очень странно помнить о ничего не значащих вещах. Например, мое первое, как мне кажется, осмысленное воспоминание: мне года 3(?), мы с дедом гуляем по заснеженному парку, он катает меня на санках. Или другой образ из детства: автомат с газировкой. Я жду своей очереди, чтобы бросить монетку, у меня в руках металлическая кружка. И еще миллион подобных образов: из школы и универа, из повседневной жизни, путешествий и поездок, странных или обыденных дней.
Наверняка умные люди уже давно занимаются исследованием вопросов памяти и воспоминаний, и мои наивные догадки вряд ли претендуют на откровения. Скорее это попытка отдельного индивида осмыслить свою жизнь, перебрать старые файлы и папки, осмыслить свежедобавленные, подготовить место для новых.
Подписаться на:
Сообщения (Atom)
